Pepenele galben nu are licopen, care este substanța chimică care produce o culoare roșiatică în fructe și legume, cum ar fi roșiile și grapefruitul roșu. În timp ce cantitățile mari de licopen din pepenele roșu îi conferă un interior roșu-roz, lipsa licopenului din pepenele galben dă o culoare gălbuie..